بررسی تنوع ژنتیکی جنسCrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن 16S rRNA
Authors
Abstract:
16S rRNA یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله‌ی ژنوم میتوکندریایی کد می‌شود و به طور گسترده‌ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه‌های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به Crassostrea مورد استفاده قرار می‌گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16S rRNA ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (Crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. واکنش زنجیره‌ای PCR از طریق یک جفت آغازگر برای تمام نمونه‌ها انجام و سپس محصولات PCR، توالی یابی اتوماتیک شدند. سپس اطلاعات بدست آمده از طریق برنامه‌ها و نرم افزارها مورد آنالیز قرار گرفتند. برای ژن مورد بررسی تنها 2 موتاسیون مشاهده شد و تنوع نوکلئوتیدی (Pi) 00061/0 محاسبه گردید. در میان 30 نمونه، تعداد 3 هاپلوتیپ شناسایی شد میانگین تنوع هاپلوتیپی (Hd) 195/0 محاسبه گردید. هاپلوتیپ‌های بدست آمده از تحقیق حاضر برای اولین بار در بانک ژنی ثبت گردیدند. رسم درخت های فیلوژنی حاصل از داده های توالی یابی ژن مورد نظر هیچ جدائی مشخصی را برای نمونه های مورد مطالعه در بندر امام خمینی فراهم نکرد. نتایج حاصل از این تحقیق نشان داد که تمایز توالی پائینی در جمعیت مورد بررسی در بندر امام خمینی وجود دارد.
similar resources
بررسی تنوع ژنتیکی جنسcrassostrea در سواحل بندر امام خمینی با روش تعیین توالی ژن ۱۶s rrna
16s rrna یکی از اجزای بخش بزرگ ریبوزومی می باشد که بوسیله ی ژنوم میتوکندریایی کد می شود و به طور گسترده ای در مطالعات فیلوژنتیکی مربوط به گونه های نزدیک و به خصوص گونه های مربوط به crassostrea مورد استفاده قرار می گیرد. پلی مورفیسم توالی نوکلئوتیدی مربوط به ژن 16s rrna ژنوم میتوکندریایی اویستر خلیج فارس (crassostrea sp.)، در 30 نمونه اویستر جمع آوری شده از بندر امام خمینی مورد بررسی قرار گرفت. ...
full textتنوع ژنتیکی میگوی سرتیز Metapenaeus affinis در خلیج فارس بر اساس توالی ژن میتوکندریایی 16S rRNA
میگوی سرتیز رتبه دوم میزان صید میگوی را در استان هرمزگان داشته و در چرخه صید و صیادی خلیج فارس اهمیت زیادی دارد. از این رو، بررسی تنوع ژنتیکی این گونه مهم مد نظر قرار گرفت. نمونه‌های میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و آبادان جمع‌آوری شدند و برای توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA مورد بررسی قرار گرفتند. بهینه‌سازی واکنش PCR جهت تکثیر ژن انجام شد. نتایج توالی‌یابی ژن 16S rRNA که شامل 486 باز هم...
full textبررسی ساختار ژنتیکی گونه ی crassostrea sp. در سواحل شمالی خلیج فارس با روش تعیین توالی ژن 16s rrna
جهت بررسی و مقایسه ی تنوع ژنتیکی اویستر خلیج فارس که قبل از این مطالعه به اویستر crassostrea gigas معروف بود، مجموعاً 30 نمونه از بندر امام خمینی و بندر عباس در آبان ماه 90 جمع آوری گردید. استخراج dna به روش ctab انجام گردید. آغازگرها از روی ژن 16s rrna ثبت شده در بانک ژنی، انتخاب گردید. واکنش زنجیره ای pcr برای تمام نمونه ها انجام و سپس محصولات pcr، توالی یابی اتوماتیک شدند. پس از تعیین توالی ا...
تنوع ژنتیکی باکتریهای گره زای ریشه یونجه در استان خراسان بر اساس توالی ژن .16s rrna
چکیده: یونجه یکی از گیاهان لگوم است که میزان زیادی علوفه تولید می کند. اغلب گونه های یونجه توانایی قابل توجهی در تثبیت نیتروژن دارند و کیفیت مراتع را در علفزارهای طبیعی و کشت شده بهبود می بخشد. باکتریهای خوانواده ریزوبیاسه قادر به تثبیت اتمسفر در ریشه گیاهان لگومینوزی همچون یونجه هستند. اهداف این تحقیق تعیین تنوع ژنتیکی میان استرین های باکتری گره زای یونجه در نمونه های جدا شده از خاک استان خراس...
15 صفحه اولگزارش گونه های نوکاردیای جداسازی شده ازخاک، توسط تعیین توالی ژن 16S rRNA، اصفهان، ایران
مقدمه: جنس نوکاردیا جزو اکتینومیستهای هوازی هستند که یک گروه بزرگ از باکتریهای ساکن خاک را شامل میشوند، که در جهان پخش شدهاند. در این مطالعه، با استفاده از آزمونهای تشخیصی رایج، مرسوم و مولکولی گوناگون، چندین ایزولههای نوکاردیا جداسازی و تشخیص داده شد. مواد و روش ها: در این پژوهش، برای جداسازی از خاک، روش Slip-buried و برای استخراج DNA، روش Microwave oven استفاده شد و در این روشها، سو...
full textبررسی مقدماتی ساختار ژنتیکی جمعیت میگوی سرتیز (Metapenaeus affinis) در آب های شمال خلیج فارس به روش توالی یابی ژن 16S rRNA
با توجه به اهمیت میگوی سرتیز (Metapenaeus affinis) در چرخه صیادی خلیج‌فارس، بررسی مقدماتی ساختار ژنتیکی جمعیت این گونه با توالی‌یابی ژن میتوکندریایی 16S rRNA انجام شد. تعداد 18 قطعه میگو از سه منطقه بندرعباس، بوشهر و خ...
full textMy Resources
Journal title
volume 14 issue 3
pages 14- 22
publication date 2015-12-01
By following a journal you will be notified via email when a new issue of this journal is published.
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023